Excel-taulukko (Excel 2007 tai uudempi versio) sisältäen projektin jäsenten ja viiteväestönäytteiden IBS-etäisyydet on ladattavissa täältä .
IBS-lukema kertoo yhteisen SNP-arvokannan suuruuden. Etäisyydet on laskettu edellisten tulosten lailla LD-karsitun aineston pohjalta, joten lukemat eivät vastaa suuruusluokaltaan perusdatan (Raw data) pohjalta laskettuja lukemia. LD-karsinta poistaa genomissa esiintyvää toisteisuutta. LD-toisteisuuteen vaikuttaa verrattavien yhteisen genomiosuuden ikä. Teen myöhemmin tämän IBS-datan pohjalta tilastoja, joten Excelin opiskelu ei ole välttämätöntä.
maanantai 25. marraskuuta 2013
Tilaa:
Lähetä kommentteja (Atom)
Some ancestral changes in Iron Age Estonia
QpAdm was designed to detect admixtures giving also probability and standard error statistics. Two kind of parameters are inputted: admixtu...
-
QpAdm was designed to detect admixtures giving also probability and standard error statistics. Two kind of parameters are inputted: admixtu...
-
There are two ancient I1 results more, one from ancient Gotland, being over 7000 years old and labeled as Stora Förvar 11. Another one repr...
-
After getting my own bam-file I found out that in some cases the quality set of FamilyTreDna is too high and in some cases the result of the...
Ei kommentteja:
Lähetä kommentti