Excel-taulukko (Excel 2007 tai uudempi versio) sisältäen projektin jäsenten ja viiteväestönäytteiden IBS-etäisyydet on ladattavissa täältä .
IBS-lukema kertoo yhteisen SNP-arvokannan suuruuden. Etäisyydet on laskettu edellisten tulosten lailla LD-karsitun aineston pohjalta, joten lukemat eivät vastaa suuruusluokaltaan perusdatan (Raw data) pohjalta laskettuja lukemia. LD-karsinta poistaa genomissa esiintyvää toisteisuutta. LD-toisteisuuteen vaikuttaa verrattavien yhteisen genomiosuuden ikä. Teen myöhemmin tämän IBS-datan pohjalta tilastoja, joten Excelin opiskelu ei ole välttämätöntä.
maanantai 25. marraskuuta 2013
Tilaa:
Lähetä kommentteja (Atom)
Some ancestral changes in Iron Age Estonia
QpAdm was designed to detect admixtures giving also probability and standard error statistics. Two kind of parameters are inputted: admixtu...
-
Testing ancient "steppe" samples on PCA together with modern ones revealed unexpected issues. Studies have included different set...
-
A new article taking place before the study tells that at least four of around twenty samples in a southwestern Iron Age cemetery (Luistari)...
-
A month ago we saw a new study, Allentoft et al. with new earlier unpublished data regarding several Bronze Age cultures. Altogethe...
Ei kommentteja:
Lähetä kommentti